En el LMA, se realiza principalmente el diagnóstico de enfermedades de plantas cultivadas mediante evaluaciones de síntomas y signos de origen fisiológico, alteraciones abióticas e infecciones presentes en las plantas. Este diagnóstico es ofrecido como un servicio.

Para el diagnóstico fitopatológico, se utilizan diversas técnicas, tales como cámaras húmedas, cultivos en agua y siembra en medios de cultivo, las cuales permiten detectar la presencia de hongos fitopatógenos a partir del tejido vegetal afectado e identificar los agentes etiológicos causantes de las distintas enfermedades.

El personal que trabaja en este laboratorio está calificado y posee experiencia en el campo de la fitopatología, microbiología y taxonomía fúngica.